O IFOP ten por misión contribuír a alcanzar o equilibrio entre os recursos do sector pesqueiro e a súa explotación. Tamén ten por obxectivo reforzar a competitividade do sector e o desenvolvemento das zonas que dependen del.
Ámbitos de actuación do IFOP: Axustes do esforzo pesqueiro; desenvolvemento da acuicultura; modernización da flota.