O obxectivo n.° 2 dos Fondos Estruturais persigue a dinamización das zonas con dificultades estruturais, ben sexan industriais, rurais, urbanas ou que dependen da pesca. Esas zonas pertencen a rexións cun nivel de desenvolvemento que se sitúa arredor da media comunitaria, mais que, en cadansúa escala, padecen diferentes tipos de dificultades socioeconómicas e que, a miúdo, son a causa dunha taxa de desemprego elevada. Estas dificultades son: Os cambios nos sectores industriais ou de servizos; Un declive das actividades tradicionais en zonas rurais; Unha situación de crise no medio urbano; Dificultades que afectan á pesca.
En España, durante o período 2000-2006, son beneficiarias do Obxectivo n.º 2, dos Fondos Estruturais, zonas das Comunidades Autónomas de Aragón, Baleares, Cataluña, Madrid, Navarra, País Vasco e A Rioxa. Entre 2000 e 2006 vanse aplicar nestas zonas fondos estruturais por un montante de 2.651 millóns de euros (de 1999). A aplicación deses recursos realízase en virtude do estabelecido en documentos plurianuais de programación, denominados Documentos Únicos de Programación (DOCUPs) e Complementos de Programas.