De la mateixa manera que durant el període 1993-1999, per al període 2000-2006 els quatre països beneficiaris són Espanya, Portugal, Irlanda i Grècia. No obstant, abans de finals de 2003 es reexaminarà el dret a les subvencions d'aquests països, en funció dels avenços que assoleixin i dels indicadors socioeconòmics actualitzats.
El percentatge del pressupost assignat a cada Estat és el següent: Grècia 16-18%, Irlanda 2-6%, Portugal 16-18%, Espanya 61-63.5%
El pressupost per a aquest Fons passà de 15.000 milions d'euros per al període 1993-1999 a 18.000 milions d'euros per al període 2000-2006.
Les dotacions anuals tenen en compte la taxa d'inflació, de manera que, en termes reals, el Fons de Cohesió roman estable.
| Año |
2000 |
2001 |
2002 |
2003 |
2004 |
2005 |
2006 |
Total |
| Cuantía |
2.615 |
2.615 |
2.615 |
2.615 |
2.515 |
2.515 |
2.510 |
18.000 |